Карьера Андрея Травникова началась в вооружённых силах СССР, где он служил с 1990 по 1992 год. Затем он работал на Череповецком металлургическом комбинате до 2006 года. С 2006 по 2010 год Травников был генеральным директором ООО «Электроремонт».
В 2010 году он стал первым заместителем мэра Череповца, а в 2012 году — первым вице-губернатором Вологодской области. С 2014 по 2016 год занимал должность заместителя полномочного представителя президента РФ в Северо-Западном федеральном округе.
С 7 ноября 2016 года по 6 октября 2017 года Травников был мэром Вологды.