Алексей Эмильевич родом из Харькова, школу окончил в Кемеровской области, затем учился на физическом факультете Томского государственного университета. В 1958, в год основания новосибирского Академгородка, переехал в Новосибирск и поступил на работу в только что организованный научно-исследовательский институт Министерства геологии СССР – Сибирский научно-исследовательский институт геологии, геофизики и минерального сырья (СНИИГГиМС). С геологией оказалась связана вся последующая жизнь Алексея Конторовича: в институте он прошёл путь от начинающего инженера до доктора геолого-минералогических наук, профессора, главного научного сотрудника Института нефтегазовой геологии и геофизики Сибирского отделения РАН.
Сфера научных интересов Алексея Конторовича была связана с нефтеразведкой и нефтедобычей. Его интересовали самые разные аспекты: от теории образования нефти до методик нефтеразведки и даже экономики нефтегазового комплекса. Он внёс неоценимы вклад в исследование Западно-Сибирской, Лено-Тунгусской и Лено-Вилюйской нефтегазоносных провинций, разработку комплексных программ поиска нефтяных и газовых месторождений в Сибири и Якутии.
Алексей Конторович был награждён множеством государственных и международных наград, в том числе и орденами: «За заслуги перед Отечеством» II и III степени, Почёта, Трудового Красного Знамени.
Соболезнования родным и близким выдающегося ученого уже принесли власти области и города, а также руководство Сибирского отделения Российской академии наук.
К сожалению, это не единственная утрата, которую понесла сибирская наука в последнее время: в конце сентября в Новосибирске скончался Владимир Завьялов, доктор медицинских наук, известный психиатр, психотерапевт и создатель метода психотерапии «дианализ».